慈禧从不同方面大肆清算改革，共展开三波反击。
先看第一波。
1898年9月21日下旨通缉康有为、康广仁，并将御史(监察官员)宋伯鲁革职;23日和24日，先后在北京逮捕谭嗣同(34岁，军机章京)、杨锐(42岁，军机章京)、刘光第(40岁，军机章京)、杨深秀(50岁，监察御史)、康广仁(32岁，无官
职，协助其兄改革)、林旭(24岁，军机章京)、张荫桓(62岁，户部左侍郎，相当于财政部副部长，当时负责京师矿务铁路总局)、徐致靖(54岁，礼部右侍郎)等8人。
28日，慈禧得到荣禄告密之后，以“谋围颐和园、劫制皇太后”等罪名，下旨将杨锐、刘光第、谭嗣同、杨深秀、康广仁、林旭6人“即行处斩”，不审而诛，史称“六君子”。29日，下旨将张荫桓发配新疆，交地方官“严加管束”(1900年被斩于新疆)。徐致靖“永远监禁”。
再看第二波。
六君子被杀之后，清廷暂停了几天迫害和杀戮。从10月4日起，慈禧又开始清算。
首先整顿大内。4日，她亲自审讯，将亲近光绪和珍妃的太监杨瑞珍、杨长文、张得明、戴恩如4人残酷地当场“杖毙”，罪名是“干预国政”、“串通是非”，活活打死之后“抛入万人坑”。另10名同情光绪的太监分别处以“重责二百板、永远枷号”和“板责一百、枷号二年”的残酷刑罚。
10月8日，将光绪软禁在中南海瀛台，将瀛台所有建筑的门全部“堵砌”，并将孤岛瀛台通往对岸的桥板撤掉，派出大量人员看管。珍妃则被施以杖刑，禁锢在中南海淑清院。4年前(1894年)，慈禧就曾抓住珍妃的一个过错，处死珍妃手下的太监，并命太监李莲英对珍妃进行“杖责”，有的史书还说是脱光了珍妃的衣服打棍子，果其如此，当是对皇妃前所未有的羞辱。慈禧这样做，当然是为了打击光绪。珍妃是光绪的最爱，慈禧对珍妃实施毒辣手段，乃至后来处死珍妃，给光绪造成了无法言表的精神刺激。
慈禧还同时对朝臣继续痛下杀手。自10月4日起，将李端、陈宝箴、陈三立、江标、熊希龄、王锡蕃、李岳瑞、张元济、王照、文廷式等人革职，“永不叙用”。后又陆续革职几十人。
除六君子之外，这些维新志士，在今人心中，恐怕已经“身名俱沉”。为追思改革百年之悲，特对部分革职者做一简介。
李端 (1833～1907)，贵阳人，刑部尚书(相当于司法部长)。光绪于9月4日罢免礼部尚书怀塔布等六大臣，5日任命李端为新的礼部尚书。李端1896年曾上《请推广学校折》，首次倡议设立京师大学堂(即今北大)。李端还将堂妹许配给梁启超，并向光绪推荐康有为、梁启超等人。革职发配新疆两年后赦还，回贵阳办学。
陈宝箴(1831～1900)，江西修水人。1895年任湖南巡抚(湖南第一把手)，与按察使(负责法律、监察的副省级官员)黄遵宪、学政江标在湖南力行新政，办时务学堂，引进梁启超、谭嗣同讲学，是清末地方大员中力主变法的风云人物。革职后回老家隐居。1900年，慈禧下旨令陈宝箴自杀。
陈三立(1853～1937)，陈宝箴之子，著名诗人，吏部(相当于中央组织部)主事。与谭嗣同、丁惠康、吴保初合称“维新四公子”，协助父亲在湖南推行新政，革职后陪父亲隐居。后与人合办铁路公司。1911年时反对武昌起义。以后日趋保守。1928年，徐悲鸿为陈三立画像。其子陈寅恪、陈衡恪分别为著名史学家、画家。
熊希龄(1870～1937)，湖南凤凰县人，翰林院庶吉士(皇帝顾问机构的中低级官员)，协助陈宝箴在湖南推行新政，任时务学堂总理。民国成立后进入政界，历任财政总长、国务总理。后辞职专心于社会事业，创办香山慈幼院并投身抗日救亡。毛泽东说：“熊希龄是做过许多好事的。”周恩来说：“熊希龄是袁世凯时代第一流人才。”
张元济(1867～1959)，原籍浙江海盐，出生于广东，总理衙门章京。被光绪破格召见，陈述意见。张元济曾建议设“议政局”总揽大权进行政治改革。革职后下海主持商务印书馆，是近代中国出版业奠基人之一。中华人民共和国成立后，任第一届全国政协委员、全国人大代表。毛泽东曾接见张元济，询问当年光绪召见的情景。
王照(1859～1933)，天津人，礼部主事。上书请求光绪访问日本，了解明治维新成功之道，被怀塔布阻挠。光绪怒罢怀塔布等六大臣，赏王照三品顶戴，导致斗争白热化，王照陷入漩涡中心。政变之后，王照逃往日本。他在日本受日文假名启发，研究汉语拼音字母。1900年回国，推广汉语拼音。
黄遵宪(1848～1905)，广东梅州人。黄遵宪自30岁至47岁，先后担任驻日本、美国、英国、新加坡外交官，写出名著《日本国志》和《日本杂事诗》。1896年，在上海参与组织强学会，创办《时务报》，鼓吹变法。同年被光绪任命为湖南按察使，与陈宝箴等协力新政，使湖南风气大变，被保守势力嫉恨。1898年7月被任命为驻日本公使。他从湖南启程到上海，见京师形势不妙，滞留上海不肯进京。10月8日，清廷密电两江总督(总管江西、江苏、安徽三省军民政务的大员。清初江苏和安徽同属江南省，因称两江总督)刘坤一，将黄遵宪秘密看管。黄遵宪被软禁，中外震动，日本展开救援，保住了他的性命。
以上两波，均为人事方面的报复。除人事之外，还展开了政策面的清算，是为第三波。
慈禧特别痛恨自由的新闻界。10月9日，清廷发布上谕说：
前经降旨将官报、时务报一律停止。近闻天津、上海、汉口各处，仍复报馆林立，肆口逞说，捏造谣言，惑世诬民，罔知顾忌，亟应设法禁止。著各该督抚认真查禁。其馆中主笔之人，皆斯文败类，不顾廉耻，即由地方官严行访拿，从重惩治，以息邪说而靖人心。
由此可见慈禧的倒行逆施。慈禧万万没想到的是，两年多之后，由于一系列内忧外患的逼迫，她竟然自掌嘴巴，不得不重新走上戊戌变法的道路，企图挽救大清。但是，由于一再错过良机，终于导致大清覆灭。
了解更多清朝历史故事欢迎继续阅读本网站哦。