在北京故宫东北角的贞顺门里面有一口珍妃井，这口井正是见证
珍妃之死
的唯一证据。对于珍妃是怎么死的以及当时的实情如何，至今还没有定论。从流传的稗官野史和小说来看，对于珍妃死亡之谜主要有两种说法。第一种：珍妃是被慈禧杀害
1900年8月，八国联军马上就要兵临城下，攻占北京城。慈禧决定带着光绪等一行人往西安避难。此时的大家都换上了平民百姓的布衣聚集在寿宁宫，慈禧忽发感触，出珍妃于牢院。强行将珍妃带走又不方便，留下又怕其年轻惹出是是非非，于是命太监将乐寿堂前的井盖打开，要珍妃跳井自尽，但珍妃坚持不肯死，于是令太监将珍妃推入井中。执刑此命令的是慈禧的领班太监崔玉贵。
第二种是：珍妃是投井自杀。
这一说法并不被大多人认同，因为珍妃虽然被囚禁在紫禁城内，但是一直以来仍然对光绪皇帝充满幻想，这也是她支撑她活下去的希望。在慈禧西行时，她也正好有机会见到光绪帝，采取自杀的方式了结自己的生命是不太可能的。
此外，在《庚子国变记》一书中记载，光绪二十六年七月二十一日(1900年8月15日)黎明，联军已攻入北京，慈禧、光绪两宫仓皇“西狩”，当时扈从的人很少，许多妃子、宫女都被打发走了。珍妃最得光绪宠爱，但太后不喜欢她，不让她跟光绪一起出奔，珍妃“乃投井死”。问题是，正被囚禁中的珍妃，何以能走出禁所并自行投井呢？书中并未作说明。
事情的真相到底如何，至今无人知晓，成为又有一