据说，在远古时代，日本并没有坚硬的大地。那时的日本国土，像一块漂浮在水面上的油脂，又像一团海蜇，在大海中浮游。慢慢地，从这柔软的浮游体中，萌生出一个像芦苇芽那样的东西，化成了神，这是一位男神，叫芦苇神。芦苇神升到天空里的 “高天原” 上去，那儿同时还诞生了四位神 ，它们是：众神之主、生长之神、冥幽之神和永生之神。
五位天神住在高天原上，又生下几对神的兄妹。其中最小的一对兄妹，是众神中最聪明能干、最美丽的。哥哥叫伊那歧，妹妹叫伊那美。天神命令他俩去修固漂浮着的国土，然后结为夫妇，生产新的土地。众神赐给他们一支镶着美玉的长矛，让他们当作工具。
伊那歧和伊那美站在上通往下界的道路 “天浮桥” 上，把长矛探入海中，“咕噜、咕噜” 地搅动海水，海水泛起的浪涛将漂浮的国土推到长矛旁边。当他们从水里提起长矛的时候，矛尖上的海水滴落到飘浮的、柔软的国土上，积聚成岛屿，有了坚实的土地，国土就这样诞生了。
创造了国土之后，两位神就沿着天浮桥走到坚硬的大地上来。他们把长矛插进地里，树起象征的权威的大柱子，叫 “天之御柱”；又建立起朝拜天神的大庙 “八寻殿”。做完这一切，就该他们结婚了。虽然他们是兄妹，但要装作不认识的样子。于是他们绕着天之御柱走，假装偶然邂逅。
两人一个从左，一个从左，绕过大柱子，相遇了。伊那美先开口说道：
“哎呀呀！我遇到多么好的一个男子！ ”
伊那歧接着说：“哎呀呀！我遇到多么好的一个女子！”
两人结婚了，可是，由于女人先讲了话，很不吉利，他们生 下的第一个孩子是个像水蛭一样软乎乎的怪胎。他俩把怪胎放进芦苇做成的小船里，任它顺水漂走了。
伊那歧和伊那美去请教天神该怎么办。天神让他俩去占卜，看神的预言如何。占卜的结果，神意指明了原因：“上次是因为女人先说话了，才会有不好的结果，回去重说。”他们回到天之御柱下，重新绕着柱子走。这一次，伊那歧先说了话，所以，他们的婚姻后来吉利了。
这一对神的夫妻先生下日本国的八大岛，成为日本国的主要岛屿，因此日本又称八大岛国；后来又生下六个小岛，分布在八大岛周围，日本就成了多岛之国了。
生完国土，他们又生诸神。他们生下三十五个神子，命令他们分别掌国土上的水流、土地、灌溉、清洁、风、雨、雷、电、交通、运输、食物、生长、烹饪、人类、动物等等，岛国上的神灵各司其职，一切都井井有条，人类安居乐业，动物繁荣兴旺。可是，伊那美却在生下火神的时候，被儿子烧死了。
伊那歧伤心极了。他哀哀地哭泣，流下的泪水化成一位爱哭的女神 “泣泽神”。他由哀而恨，把失去伊那美的原因归咎于火神，一时冲动，拔剑杀死了火神。火神的血溅在石上，流入地下，沾上火神血迹的石头、泥土，加上火神尸体的各个部分，又化成了十个神。
杀了儿子火神，虽然解了心头之恨，但悲哀仍然萦绕着伊那歧。他决定到阴间去把妻子找回来。
伊那歧走了很久，终于来到黄泉国的宫殿门外。他拍拍门，伊那美开门迎接他。这儿光线暗极了，伊那歧只能凭声音辨别妻子所站的方向。他对妻子说：
“妻啊！我们创造国土的使命还没有完成，请跟我回去吧！ ”
伊那美也很难过，她说：“可惜呀！你没有早些来。我已经吃了黄泉的饭食，变成这儿的鬼了。我很愿意跟你一道回去，请你等一等，让我和黄泉的神商量商量。可是，这期间千万不要看我呀！ ”
伊那美回到阴间的宫殿里去了。伊那歧坐在门外等，等了好久，还不见她出来，他就不耐烦了，起身进去看。大殿里黑森森的，伸手不见五指。伊那歧取下左发髻上戴着的多齿木梳，折下一个边齿，点起一个小小的火亮，向前照去。这一照，可吓了他一大跳。他看见伊那美躺在地上，已经腐烂了，浑身爬满蛆虫；身体各处及手脚上，有八个大雷神伏在那儿。伊那歧看到这种景象，吓得大叫一声，扔下梳齿，转身就跑。伊那美见丈夫不守诺言，私闯入宫，看到了自己的丑样子，十分恼怒。她立即派黄泉丑女去追赶伊那歧，带回来听她发落，又命令八大雷神前去围追堵截。
伊那歧拼命奔逃，黄泉丑女紧追不舍。眼看就要追上了，伊那歧急中生智，取下头上的黑发饰，扔到地上。地上长出了新鲜水灵的野葡萄。黄泉丑女见到葡萄，忘了追赶伊那歧，去摘葡萄吃。伊那歧赶紧逃命。
黄泉丑女吃够了，抹抹嘴，想起要做的事，又追了上来。伊那歧看看共同泉丑女近在咫尺，又赶忙取下插在右发髻上的多齿木梳，折下梳齿，撒在地上。地上长出鲜嫩的竹笋。乘黄泉丑女拔竹笋吃的时候，他向着阳界飞跑。
前面就是黄泉国与阳间的交界处，跨过最后一道屏障，就可以平安回家了。这时，八大雷神率领的一千五百名黄泉军追上了伊那歧。他们在伊那歧身后排成一个半圆形的环阵，呐喊着包抄过来。伊那歧眼看就要变成瓮中之鳖！他十分害怕，一步步退向阴阳边界，注视着步步逼近的黄泉军。退着，退着，他回了一下头，忽然看到边界上有一棵桃树，上面结满了又大又鲜的桃子，红灿灿迎风摇摆。他猛地转过身，扑过去，摘下三个桃子，掷向黄泉军。黄泉军见桃子飞来，立刻四下逃散，溃不成军，跑回黄泉国去了。
伊那歧脱了险，很感激桃树。他对桃树说：“谢谢你。将来大地上的众生要是遇到灾难的时候，你要像刚才帮助我那样，去帮助他们。 他赐桃树为大仙桃神，从此，桃树就有了驱邪避灾的本领。 ”
黄泉军回去报信，伊那美亲自追来。此时，伊那歧已经回到阳界了。他们站在阴阳交界处的大石头两边，发出了决绝的誓言，从此两位神 反目为仇。
伊那歧回家之后，总是忘不掉在阴间看到的伊那歧腐烂的情景，时时处处似乎都能闻到阴间腐恶的臭气。他决定举行一个“祓禊仪式”，清除从阴间带回来的丑恶和污秽。他来到一个高原上，在那里举行这个仪式。他扔掉了到阴间去时拄的手杖、穿的衣裳、戴的帽子和手上的饰物，又在大河里洗浴了身体，清洗了两眼和鼻子。
他扔掉的东西和身体上洗下的污秽，分别化成了二十三个平安之神和灾难之神。最后他清洗左眼的水化成一位女儿，取名叫天照大御神；清洗右眼的水化成的神是个儿子，取名月读尊；洗鼻子的水化成的神也是个儿子，取名叫素戋鸣尊。这三个孩子十分美丽，且聪明颖慧。
伊那歧高兴极了，他说：“我生了这么多孩子，最后终于得到三位贵子。”
天照大御神有着灿烂的金色的脸庞，散发着温暖的光芒。伊那歧取下自己脖子上戴的玉串，摇得琮琮作响，赐给天照大御神，对她说：“去治理高天原！”天照大御神就到天上，去做了日之神。
月读尊有着银白色的脸庞，散发着柔和的光辉。伊那歧命令他说：“你去治理夜之国！ 月读尊就到天上，做了夜之国的首领月之神。”三子素戋鸣尊不如他的哥哥、姐姐漂亮，但也很美丽。伊那歧命令他说：“你去治理海洋！ ”说完，伊那歧就离去了。
天照大御神和月读尊按照父亲的吩咐，到职上任了。只有素戋鸣尊不肯去治理海洋。他一屁股坐在地上，哭了起来。姐姐和哥哥都去了天上，只让他到那动荡的、冰冷的、深不可测的大海里去，不是太不公平了么？他下决心不受父命，宁肯去黄泉国与母亲在一起，也不去大海里掌管海浪和鱼虾。伊那歧听见素戋鸣尊的哭声，知道他在闹别扭，也不去管他，心想，他哭一阵自然会收敛泪水，去作海洋之神的。谁料到，这素戋鸣尊如此能哭！他从生下来起，一直哭到胡须长到八拳长，还不肯停止。看样子，不哭倒青山、哭干大海，他是不会作罢的。他的哭闹声充斥宇宙，像夏日里的苍蝇一样，到处嗡嗡营营，讨厌极了，许多灾祸因此而起。看来，不理睬他也不是办法。伊那歧来到儿子身边，对他说：“停止你的哭泣，素戋鸣尊。你为什么不去治理你的国土，却在这儿痛哭？ ”
素戋鸣尊回答说：“我不想去大海，而想到母亲居住的黄泉国里去，所以才哭泣。 ”
伊那歧闻言，想起黄泉国里受惊的一幕和绝情的妻子，勃然大怒。他吼道：“那你不要再住在这个国土上，滚到阴间去吧！ ”素戋鸣尊停止哭泣，擦干眼泪，说：“这么说，我可以不去海洋了？好吧，我去向天照姐姐辞行，然后就到阴间去找母亲。”说完，他使劲一跺脚，飞升上天，找日照大御神辞行去了。没想到，他这一脚跺得山川摇撼，国土震动，天地间 “哗啦啦” 一阵乱响。天照大御神听到了，心下思忖：
“他这一来必无好心，一定是想来夺我的国土！ ”这样想着，天照大御神赶紧准备：她换下女装，穿起男子的战衣，戴上皮护腕，携弓挎箭，英姿飒爽，站在天浮桥上，等弟弟来后，刀兵相见。
素戋鸣尊上天来了。他看到姐姐如此模样来迎接他，十分不悦。姐弟相见，问明原由，天照大御神知是自己多疑了。可她还是不放心，命令弟弟站到银河对岸去，用一项行动来证明他心地纯洁，对姐姐的国土和权位并无野心。素戋鸣尊无奈，只好嚼碎玉珠串，生出许多神 ，以证明自己清白。天照大御神这才相信了他，因为若是他心怀不轨之谋，是生不出神来的。
天照大御神请素戋鸣尊到高天原，向他赔礼，请他原谅自己心胸狭窄的猜忌。素戋鸣尊得了理，却不肯罢休了。他乘机大闹高天原，搞得一塌糊涂。他毁坏了天照大御神在高天原上修造的田埂，填平了田里的沟渠，还往庆祝丰收的祭祀堂上拉屎。最后，当天照大御神在天女织衣房里，看织女织造神衣的时候，他拆毁了机房的屋顶，将天斑马剥了皮，扔进机房，把织女吓死了。
素戋鸣尊这样无法无天的胡闹，使天照大御神惊恐万分。她悄悄躲进她的住所天石屋，紧闭门户，不肯出来了。顿时，高天原一片漆黑，大地上失了光亮，走进漫漫长夜。凶神们乘着黑暗，一齐出动，各种各样的灾祸都出现了。
高天原上的八百万天神十分焦虑，他们召集紧急会议，商议对策，决定用计谋请天照大御神走出天石屋。
众神召来公鸡，命它啼鸣；取来银河上的砧铁，采来天金山的铁矿，请来神和人类中手最巧的锻冶工匠，造出一面八尺高的大圆镜。又到天香山上，连根拔出枝繁叶茂的真贤树，将大镜挂在树枝上，四周装饰上许多玉串、白布和麻布，做成祭祀的样子，抬到天照大神的天石屋外面，把大镜子直对着屋门。之后，又吩咐两位大力神藏在门边，众天神绕石屋站定，大声唱歌。
一切安排之后，一位强悍泼辣的女神拿来一只空桶，倒扣在天石屋门外，用脚踏得咚咚响。众神唱着歌，不时爆发出阵阵哄笑，好像在举行盛大的庆祝仪式一般。天照大御神听到外面吵吵嚷嚷，觉得很奇怪。她把天石屋的门拉开一条细缝，从里面说道：“我隐居在这里，高天原应当是黑暗了，大地上也将陷入黑夜，为什么你们还在欢笑歌舞呢？ ”泼辣强悍的女神边舞蹈边回答说：“来了一位比你更尊贵的天神，我们欢乐歌舞，是为了迎接他到来呀！ ”天照大御神不相信会有比自己更尊贵的天神，她把门缝悄悄开大了一点，门外的大镜子映出她自己的影子，亮得耀眼。她更奇怪了：“有谁跟我一样明亮呢？ 她又开大门缝，探出身子往外 ”瞧，看那位新来的天神究竟什么样儿。这时，藏在门外的大力神急忙抓住她的手，把她拽了出来。别的天神连忙把标志 “禁止出入” 的草绳拦在石屋门前，说：“不准再回到里面去了！ ”天照大御神出来了，高天原和大地上，又充满了光明，天神和人类真的庆祝起来了。
素戋鸣尊闹出了祸事，自知理亏。八百万天神商议，罚他交出赎罪的物品，割去胡须，拔掉手指甲和脚趾甲，将他放逐到大地上去了。
后来，素戋鸣尊在大地上成了食物之神，创造了五谷，给人类作食粮；又替人类斩杀了八头八尾的巨蛇，除了地方一大害人精。他娶了当地一个老汉的女儿为妻，选中须贺地方，定居下来，成为日本天皇的祖先。