嘉庆元年(1796年)，乾隆皇帝举行传位大典，把皇位传给十五皇子嘉亲王锸琰，自己当起了太上皇。但是乾隆依旧没有放弃权力，规定凡遇到军政用人之大事都要亲自过问，和?也就还得以专权。但毕竟形势发生了变化，和?当然也有所顾虑，担心嘉庆皇帝日后会处治他，所以他也要为自己想后路。首先，他极力限制嘉庆培植自己的势力。
不久，乾隆准备召朱?回京升任大学士，和?感到这是对自己的极大威胁。当嘉庆写诗向老师表示祝贺时，和?便迫不及待地拿着尚未写完的诗稿，向乾隆打小报告，诬称“嗣皇帝欲市恩于师傅”。这一次，乾隆生气了，问身旁的军机大臣董诰：“这在法律上属于什么行为？”幸亏董诰跪谏：“圣主无过言”，乾隆才得以作罢。但是，朱?内召升用一事也就随之泡汤了，而后和?又找了个借口鼓动乾隆把已任两广总督的朱?降调为安徽巡抚。后来，朱?先后升授兵部尚书和吏部尚书，本来应该回京任职，但和?始终不简放新任安徽巡抚，使得朱?只得继续留任，不能交卸工作。同时，和?又将其老师吴省兰派到嘉庆身边，表面上是帮助嘉庆整理诗稿，事实上是在监视嘉庆的一言一行。
嘉庆皇帝也颇有心机，他知道只要太上皇乾隆还在，自己就动不了和?，而且和?在一定程度上能左右乾隆的旨意，搞不好反而对自己己不利，所以他韬光养晦，事事顺从乾隆，不发表自己的意见，也容忍和?继续专权。当有人向他说和?坏话时，他反而批评说，我还要依靠和?来治理国家，你们为什么要反对他呢？甚至嘉庆有事要奏明乾隆，也有意托和?代为请奏，以表示对和?充分信任。经过一段时间的相互试探，嘉庆终于将和?麻痹了。
嘉庆二年(1797年)，领班军机大臣阿桂病逝，和?理所当然地成了领班军机大臣。这时，大学士王杰因看不惯和?已称病告退，董诰丁忧回了老家，和?在军机处可以任意呼风唤雨了。加上，乾隆日益年迈，记忆力下降，“昨日之事，今日辄忘，早间所行，晚或不省”。和?出纳帝命，口衔天宪，颐指气使，为所欲为，“封擅甚于前日，人皆侧目，莫敢谁何”。
但是盛极而衰，和?的好日子也走到头了。一进入嘉庆朝，和?就接连遭受家庭的不幸。嘉庆元年七月，被和?视若掌上明珠的次子才两岁就夭折了。一个月后，其情同手足的弟弟和琳在贵州军营染受瘴气身亡，使和?如失臂膀，打击很大。次年，和?又添新痛，他唯一的孙子又夭折了。嘉庆三年二月，结发妻子冯氏也去世了，和?虽姬妾如云，但与冯氏感情最深，曾经写了多首诗悼念亡妻，其中有“今日我哭伊，他年谁送我”之句。斯言如谶，在连续三年家中死去四个亲人后，和?本人的死期也不远了。
嘉庆四年正月初三日(1799年2月7日)，八十九岁高龄的乾隆终于驾崩，和?的大靠山没了，嘉庆就无所顾忌了。但是，嘉庆并没有马上对和?下手，当天还任命和?与睿亲王淳颖等一起总理丧仪大事。不过，也就在同一天，嘉庆传旨召他的老师朱?即速回京，就已经发出信号了。
初四日，嘉庆发了一道圣旨，谴责前方镇压白莲教起义的将领“惟思玩兵养寇，藉以冒功升赏”，矛头已直指后台的和?。当天，突然解除了和?、福长安的军机大臣之职，命其昼夜在大内为乾隆守灵，不许出入，将其软禁在宫中。
初五日，御史广兴、给事中王念孙等纷纷上疏，弹劾和?种种不法罪状，这也可能是经嘉庆特别授意的。初八日，在公布太上皇乾隆遗诏的同时，嘉庆宣布革去和?、福长安的一切职务，交由刑部收监，并命额附拉旺多尔济、定亲王绵恩、仪亲王永璇及大学士刘墉、董诰、兵部尚书庆桂等负责查抄其家产，共同审讯。
十一日，在初步查抄审讯后，嘉庆宣布了和?的二十大罪状，主要有欺君罔上、贪婪聚敛、压搁军报、僭越制度、任用私人等，并通报各省督抚，命其讨论定罪，也就是要他们都表个态。嘉庆在上谕中处处谴责和?获罪于先皇乾隆，那么在大丧期间处置这位先皇的宠臣也就名正言顺了。
正月十六日，直隶总督胡季堂议覆奏折首先上书，折中称“和?罪大恶极，目无君上，蠹国病民，贪黩放荡，真一无耻小人”，请嘉庆帝“特颁谕旨，将和?照大逆律押赴市曹，凌迟处死”。嘉庆御批：“在京文武三品以上官员并翰詹科道悉心妥议具奏”，若有不同意见，“自行封奏亦可”。同时，嘉庆帝又发布了一道圣旨，重述和?的二十大罪状，并有所补充。
正月十八日(1799年2月22日)，在京文武大臣会议，奏请将“和?照大逆律凌迟处死，福长安照朋党拟斩，请即行正法。”嘉庆表示，和?罪有应得，怎么处治都不过分，但考虑到他曾任首辅大臣，为国体起见，免其肆市，加恩赐令自尽。就这样，刚刚亲政的嘉庆，仅用半个月的时间就把和?这位专权庙堂数十年的先朝宠臣给收拾掉了。
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