首先，南京为什么灵气重，因为南京冤魂太多，好坏参半，为了保住南京的安定，所以在南京设置了很多很多的大学院校。普遍知道的三个案例为1.三江学院闹鬼事件2.南大碎尸案3.江东门哭声。三江学院是按八卦方位修建的，这个请自行谷歌地图，据楼主所知三江学院晚上有很多地方是不可以去的，据说发生过灵异事件。南大碎尸案至今未破，很多人是新来南京，对老南大周边不了解，从前的南大周边，小巷十八弯。经常发生变态袭击人的。
至于以下内容，那就是传说了，无从考据
1.原浦口火车站的铁路傍晚时分十分灵异，会遇到鬼，此事是本人一位朋友在小时候撞到的，晚上他和同学走在火车铁轨上，同学叫他回头看是不是有人，他回头一看，看到有个白色的东西跟着他们后面，两个人一句话没说，飞快的走回家，再也没敢回头。
2.夜晚的南京长江大桥为事故频发地段，经常有人掉下去或者自杀，或者交通事故，无法解释。
3.石头城公园未改造之前晚上能看到鬼影，石头城原名就是鬼城。
4.第二医院晚上经常闹鬼，院长请过人来驱邪。
5.在南唐二陵处，设置有一家精神病院，据说里面关的全是杀过人的精神病人。
6.迈皋桥有一家长期无人居住的鬼屋，半夜无业游民都不敢入住，先已拆。
7.在江宁殷巷附近原来有一家做棺材生意的，那个店主据说可以看到人的寿命期限，当然，是未开发前的江宁。
以上是一些南京都市传说，本人所知有限，欢迎老南京和网友来补充。